Kalprotektiini on pääosin neutrofiilistä soluista peräisin oleva valkuaisaine, jonka määrä ulosteessa kohoaa suoliston tulehduksen seurauksena. Kalprotektiini on tasaisesti jakautunut ulosteeseen ja säilyy ulosteessa melko hyvin. Etuna on myös, että kertanäytteen ja ulostekeräyksen luotettavuus on yhtä hyvä eli ei tarvita useita eri päivien näytteitä.

Tulehduksellisia suolistosairauksia (IBD eli inflammatory bowel disease) ovat haavainen paksusuolitulehdus (colitis ulcerosa) ja Crohnin tauti. Ulosteen kalprotektiini nousee usein näissä sairauksissa. Sitä käytetäänkin erottamaan tulehduksellisia suolistosairauksia toiminnalisista suolisto-oireista, joissa nousua ei juuri tapahdu. Siitä on hyötyä myös tulehduksellisten suolistosairauksien aktiivisuuden ja hoidon tehon seurannassa. Mitä korkeampi kalprotektiinipitoisuus on, sitä suurempi on yleensä tulehduksen aste.

Normaalipitoisuus sulkee pois kohtalaisen luotettavasti aktiivisen suolistosairauden, mutta proktiitissa eli peräsuolen alueen haavaisessa paksusuolitulehduksessa, jossa peräsuoli tyhjenee tiheästi, kalprotektiiniarvo voi olla normaali.